忍者商店中售价为1980金币和1680金币的忍者大多可以通过精英副本免费获取，因此不建议直接购买。如果非要选择，恶灵之影兜是个例外，购买该忍者会额外赠送一个加战力的称号恶灵之影，性价比相对较高。忍者商店中部分A级忍者值得优先考虑，特别是须佐佐助、青年水门和白面具这三个角色。这些忍者不仅技能机制相对完善，在决斗场中也有不错的表现。青年水门操作简单，开局可直接使用霸体螺旋丸起手，反手飞雷神也极具威胁，适合新手快速上手。须佐佐助则是意识流忍者，灵活拉扯能力强，玩得好可以轻松上段位。
泳装系列忍者在商店中也有一定价值。泳装雏田不仅外观设计出色，强度也相当可观，双狮拳形态下的普攻稳定且伤害可观。泳装红豆则以空中机动性见长，技能抓取效果优秀，适合喜欢灵活打法的玩家。这些限定忍者在特定场合能发挥独特作用，但需要一定操作熟练度才能完全掌握。
关于忍者碎片的购买策略，每天限购两次的A忍碎片值得关注。志村团藏作为限定A忍，连击稳定性强，远程技能效果出色，奥义变换机制独特，是性价比较高的选择。购买碎片时需注意积分积累，以便在积分商店兑换更多资源。不建议将金币分散投入多个忍者，集中培养1-2个主力角色更为合理。偏好PVP的玩家可侧重决斗场强势忍者，如白面具的虚化机制和反弹效果；而PVE玩家则应关注群体输出能力强的角色。
