祈愿系统是玩家获取忍者碎片和资源的重要途径之一。玩家可以通过组织祈愿、活动祈愿等多种方式参与，具体操作需要满足一定条件并合理规划资源。祈愿的核心在于利用游戏内机制与其他玩家互助，或通过特定活动积累奖励。
组织祈愿是玩家间碎片交换的主要方式，需加入组织超过72小时且等级达到25级方可参与。每周一19点系统会自动补充一张祈愿绘马，玩家需在组织内发布所需忍者碎片信息，其他成员可捐赠多余碎片。需许愿或捐赠S级忍者需自身已拥有50片，A/B级需20片，C级需5片。VIP等级越高，每周可捐赠的碎片数量及单次许愿获取上限也越高。捐赠他人碎片可获得经验奖励，累计捐赠还能开启每周重置的捐赠宝箱。
活动祈愿通常以限时形式出现，例如祈愿夺宝或节日特殊许愿。这类活动需消耗特定道具如祈愿夺宝币，通过抽奖形式获取稀有忍者或装备。参与前需明确目标，优先选择心仪忍者或高价值道具，并提前积累活动所需资源。部分活动会提供免费抽取机会，但保底机制往往需要较多资源投入，建议根据自身情况合理分配。
祈愿绘马是组织祈愿的关键道具，每周仅能通过系统补充一张，若未使用则不会重复获得。因此玩家需谨慎选择许愿目标，优先申请稀有或高需求的S级、A级忍者碎片。同时应积极参与组织内碎片捐赠，维持活跃度以提高碎片流通效率。高活跃组织能更高效地满足成员需求，建议选择成员稳定的组织长期参与。除常规祈愿外，游戏还设有忍者许愿任务等玩法，通过完成每日登录、决斗胜利等条件积累心愿宝石兑换永久忍者。若对当前许愿忍者不满意，可花费少量金币更换目标。
