通关四之岛的核心在于完成红蓝宝石任务并击败火箭队残党。首先需要在一周目通关后收集60种图鉴找大木博士升级全国图鉴，随后前往一之岛灯火山取得红宝石。将红宝石交给岛屿上的研究员阿棉后获得彩虹通行证，这才能够自由往返各个岛屿。从枯叶市乘船抵达四之岛后，会遇见劲敌小茂但不会触发战斗，这是剧情的重要提示点。
四之岛的主要挑战集中在冻瀑洞窟，这里需要解决火箭队绑架科拿的事件。洞窟内部结构复杂但路线相对明确，沿途会遇到多个火箭队成员阻拦。击败洞窟深处的火箭队干部后，会得知被捕获的宝可梦被关押在五之岛仓库的情报。在洞窟探索过程中可以拾取星星碎片等隐藏道具，这些物品对后续游戏进程有一定帮助。
完成四之岛主线后，建议返回岛屿老者处获取波克比蛋，前提是队伍首位宝可梦亲密度足够且有空位。同时四之岛沙滩左上角区域藏有星星碎片，这是容易被忽视的重要收集品。水之迷宫区域需要冲浪技能才能抵达高级度假村，虽然该地点没有实质性剧情内容，但对完成全图探索有重要意义。
四之岛作为连接关都与七岛地区的重要枢纽，其通关进度直接影响后续五之岛仓库密码的获取。在离开四之岛前，务必确认已完成与科拿的全部对话并获取五之岛仓库的第一个密码。接下来的游戏进程将围绕解救被囚禁宝可梦和收集蓝宝石展开，这两项任务都需要四之岛提供的关键情报作为基础。
